盐亭县管辖1个经济开发区、2个街道、14个镇、18个乡、1个民族乡。2个街道：麻秧街道、风灵街道；14个镇：云溪镇、富驿镇、玉龙镇、黄甸镇、金孔镇、两河镇、八角镇、黑坪镇、柏梓镇、安家镇、高灯镇、金鸡镇、林农镇、巨龙镇；18个乡：林山乡、冯河乡、石牛庙乡、金安乡、永泰乡、洗泽乡、五龙乡、榉溪乡、折弓乡、宗海乡、龙泉乡、黄溪乡、毛公乡、三元乡、茶亭乡、双碑乡、剑河乡、来龙乡；1个民族乡：大兴回族乡。下设64个城镇社区居民委员会，456个村民委员会，240个居民小组和4464个村民小组。

盐亭县政府所在地云溪镇因唐代大诗人杜甫诗句“云溪花淡淡，春郭水泠泠”而得名。